Vielä muutama sata vuotta sitten koko Madagaskar oli tiheiden metsien peitossa. Ihmiset tulivat Madagaskariin Indonesian saaristosta noin 1000 vuotta sitten ja alkoivat polttaa metsiä pelloiksi. Sademetsistä on jäljellä enää vain kapea kaistale saaren itä- ja poisosassa. Eroosio on erittäin vakava ongelma. Maata huuhtoutuu jokien mukana meriin.
Voimakkaiden sateiden takia maan tieverkosto on heikko. Päällystettyjä valtateitä on vähän. Huonojen kulkuyhteyksien takia saarella on tieheä pienlentokoneverkko.
Saarella on kaksi junarataa. Toinen kulkee pääkaupungista rannikolle Toamasinaan - entiseen Tamataveen. Toinen kulkee Antananarivosta ylänköä pitkin Antsirabeen. Radat ja junat ovat hyväkuntoisia.